MSAD_210042.t1 (mRNA; Medicago sativa )

Overview
NameMSAD_210042.t1
Unique NameMSAD_210042.t1
TypemRNA
OrganismMedicago sativa (alfalfa)
Sequence length2340
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
MSAD_210042MSAD_210042Medicago sativagene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
MSAD_210042.t1MSAD_210042.t1-proteinMedicago sativapolypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
MSAD_210042.t1:cdsMSAD_210042.t1:cdsMedicago sativaCDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
MSAD_210042.t1:exon:28MSAD_210042.t1:exon:28Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:29MSAD_210042.t1:exon:29Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:30MSAD_210042.t1:exon:30Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:31MSAD_210042.t1:exon:31Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:32MSAD_210042.t1:exon:32Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:33MSAD_210042.t1:exon:33Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:34MSAD_210042.t1:exon:34Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:35MSAD_210042.t1:exon:35Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:36MSAD_210042.t1:exon:36Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:37MSAD_210042.t1:exon:37Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:38MSAD_210042.t1:exon:38Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:39MSAD_210042.t1:exon:39Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:40MSAD_210042.t1:exon:40Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:41MSAD_210042.t1:exon:41Medicago sativaexon
MSAD_210042.t1:exon:42MSAD_210042.t1:exon:42Medicago sativaexon


Synonyms
The feature 'MSAD_210042.t1' has the following synonyms
Synonym
maker-Scc4a34_16-snap-gene-0.45-mRNA-1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>MSAD_210042.t1 ID=MSAD_210042.t1|Name=MSAD_210042.t1|organism=Medicago sativa|type=mRNA|length=2340bp
ATGCATGTATTCAGTCCTGCAGGTCTAAAAGGCTCCAAGTTACATTGTGA
AAATCTAAGAGATCAATTGTTTCAATTACTTAATCACAAATCAATGGAGA
ACAAGAGGTGGTTGAACATAGTAGTTGATGGCAACAAAGCTTTGGAGCAA
TATTGGCATGATATTCTTTCAAACTATCTTGAAAAAATTGTCAGATGCTT
TGTTGGTGAAAGCCAAGAGCAGGAAAGTTATCTTGGACTAGTTCTTTATA
ATGCAAACTCTGAACTAGTGGAAGCAGGCTATGATATCCAATTTATACAC
TGGACTAAAGATGTGAATAAATATATGCAAAATTTGTCACATTTATCTTT
CAACGGAAATGATGCAAATCAATCTACCATGGCAGAAGGCCTAGCAGAAG
CTCTAGTGATGTATCCAAAGCCATGTGATACAATGACAGAAAGAGAATAC
TATAATTCAGAAAGACATTGTATTCTAGTTGCTCCAGGTGATCCTGCTCC
TAAGAGTATGCTAGTGTGTTTGCCAATGATTCAAAGAGCTCAAGTTATTG
GCCAAAGATTAAAGGCTTGTCAGGCCGATTTTCTCGAGGTCGCCAAAACA
TGTGTGCCGCTAGCTGTTTCCATGTCAGTGATAACTCCTAATCCAGTTCC
AATTTTTGGAGCCATATTTAATATGGGAAACAATGTATTAACATTGTCAA
ATGCTCCAATCTCTAGTTACAGCACTGGCCAATTAACTGTTTTACTGTCA
AAAAACTTCAAAGAGGCACACATTGCACTCAAAGGAAAAGGAATAATGGA
ATATCCTTCAACAACAAGTGTAGCATCAATCAGTGCAGCACCTGATACAA
CACTTTTCCGAGCTTTCTCTACCAATATTCAAGAAGAACAAGTATCCTCC
TCTATGGCACTAGGAGACAGAATACGTGAAACTGGCAATACTATAACACC
GGAGCCTGAAAGCACCTCGCAGCATAATTCTCAGGAGTTGGTTTTATCAA
AAGCTACAGATCAGGAGAACGTTGTTCAAATGAATCTATACGAAGATATC
ATGTCCGAGCTTGACAGCGAAAGTGATCTTTTTACACCGAATAAAAGATC
GAAAACATTTGCACCAATAGAGGATGACCCTGATCTGCTAGATTTTTTCA
AATTTGATCAAAACCCTTTTGAAGGTTTTGACCAATTCCTTGAACAAGAT
CAACAAGTATCGAACCAACAACAGATTCCGACGGAAGAAGCTGTATTCAA
CCAACAACAGATTCCGACAGAAGAAGCTGTATTCATCCAACAACAGATTC
CGACGGAAGAAGCTGGAATAGAGATTGCAAATGAGCTGCAAGAAATTCTG
AATGGTGCTTCAAGGAATACATCAACAGCTCAAACTGCCAATGTTGAATG
TACCACAAGTTCATTTCAGGAAGTGAACGTTCAGTCCGAAGAACTACAAG
CTCCTACTTCAAATGTCGGAGAAGGGTCTTCGACAGCACTGCTTCATGAA
AGCAATTTACAGTCATGGTATAATCCTCACGCCATGACGAGCACATCGAC
ATTGGATTCTCAGAGTTTCCCAACTAATGTTTTCAACGGGAATGTAACAT
TTCCTAATGTAACGGGGAACTCACCGGTGCAGCATCTTCAGCCAGGCTCG
TCATTCGATTCTCAGAGTTTCCCAACTAATGTTTTCAATGGGAATTTTAC
ATTTCCTAATGTAATCGGAAACTCTCAGATGCAGCAACCTCAACAAGGCT
CATCACAAAACCAGTTTTCCGTGTTTCCTGGTTTTGCAAGAGGACAAACA
GGCAACTTCTCGGGGCAGCCTGTGGGACAACATTTTCAGGCCAACAACCA
GTACCTGAGGAATAATAACACGGCGGCGTCTAATTTTCCTGCAATTGGAG
CAAACACTTGGTTTCGTCCGATGCCAAGCTTGTCTCCCTCGTATCTGAGC
GCGAGCATGTATTTCCCTACCCTCGAAGAAATACAAGACTACGTTCAGAC
GTGGGAGGGAACACTAGCAGGAAAAATTACGTCAAGTCGCACAACGATCC
TGAGAGCAAGGGCTTTCAGGAAATCAAGTACGCCACTAACGCTTACACTT
GGCTGGCCTGGTAGGTTAGAGATTAGCAACTATTTCCATCAAAGGACACT
CAACCATACCAGGAGATTTTCACAGCCTATACATTATCTTTTCTTTCATG
TGGCTAAGTACAGCAATGTAGATCTATACACGCACTTGAAAACCAGATAT
GAGTGTGCAAAAGTAGATCTACAGTTCCAATCAATAATCCTGTCTCCAAC
AGAAAGAGAACCAATCTTTGTTGGAACAGTATTCCCTGGG
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protein sequence of MSAD_210042.t1

>MSAD_210042.t1-protein ID=MSAD_210042.t1-protein|Name=MSAD_210042.t1|organism=Medicago sativa|type=polypeptide|length=780bp
MHVFSPAGLKGSKLHCENLRDQLFQLLNHKSMENKRWLNIVVDGNKALEQ
YWHDILSNYLEKIVRCFVGESQEQESYLGLVLYNANSELVEAGYDIQFIH
WTKDVNKYMQNLSHLSFNGNDANQSTMAEGLAEALVMYPKPCDTMTEREY
YNSERHCILVAPGDPAPKSMLVCLPMIQRAQVIGQRLKACQADFLEVAKT
CVPLAVSMSVITPNPVPIFGAIFNMGNNVLTLSNAPISSYSTGQLTVLLS
KNFKEAHIALKGKGIMEYPSTTSVASISAAPDTTLFRAFSTNIQEEQVSS
SMALGDRIRETGNTITPEPESTSQHNSQELVLSKATDQENVVQMNLYEDI
MSELDSESDLFTPNKRSKTFAPIEDDPDLLDFFKFDQNPFEGFDQFLEQD
QQVSNQQQIPTEEAVFNQQQIPTEEAVFIQQQIPTEEAGIEIANELQEIL
NGASRNTSTAQTANVECTTSSFQEVNVQSEELQAPTSNVGEGSSTALLHE
SNLQSWYNPHAMTSTSTLDSQSFPTNVFNGNVTFPNVTGNSPVQHLQPGS
SFDSQSFPTNVFNGNFTFPNVIGNSQMQQPQQGSSQNQFSVFPGFARGQT
GNFSGQPVGQHFQANNQYLRNNNTAASNFPAIGANTWFRPMPSLSPSYLS
ASMYFPTLEEIQDYVQTWEGTLAGKITSSRTTILRARAFRKSSTPLTLTL
GWPGRLEISNYFHQRTLNHTRRFSQPIHYLFFHVAKYSNVDLYTHLKTRY
ECAKVDLQFQSIILSPTEREPIFVGTVFPG
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mRNA from alignment at Scc4a34_16:11587..21017-

Legend: CDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSAD_210042.t1 ID=MSAD_210042.t1|Name=MSAD_210042.t1|organism=Medicago sativa|type=mRNA|length=9431bp|location=Sequence derived from alignment at Scc4a34_16:11587..21017- (Medicago sativa)
ATGCATGTATTCAGTCCTGCAGGTCTAAAAGGCTCCAAGTTACATTGTGA AAATCTAAGAGGTGAGTTTCATAAATCAATATTTTCTTTTTCTTGATTTC ACTATTTTTCGATCTAACAATTGCCTTTTTAATTATTATTTTTCTTTCTA TTTTTTCTCTGTAGATCAATTGTTTCAATTACTTAATCACAAATCAATGG AGAACAAGAGGTGGTTGAACATAGTAGTTGATGGCAACAAAGCTTTGGAG CAATATTGGCATGATATTCTTTCAAACTATCTTGAAAAAATTGTCAGGTT TGATTATTCACAATCCTTGTATATAATATATCACTTTGCCACATAATTTC TTTTTGCAACCAAAAAATAATACTAATATGGAGAATTGGGAAGAAAATAT TTTTTAGTAAAAACTAATGGAGAATTATGGTATAGTTTTCACATGATGAT TCATACTTTCACTCATGCATGAAGACTAATAAGATAAGGTGACAAAATGT CAAGGTCGAAACATATGACGTATGTGACTTATATGACGTATATGTAATTT TTTTTTTGAAGGATGACGTATATGTAATTGGTATGGTTAATTAAATGGTA TAATCAAATATGCAGTATAATTATTAAGAAAATATTTTAATTCCTTTCAG AAAAAGAAATTATTTTTATAGATATATCACAAAAAGAGAAAATGTTTTAA TGTTTGGTGGTTGGTGTATATAGAGTTGAATGTGGTCAAAATTTTCAGTC AAAATAAGAAAGTGGTCAAAACTATACCAAAAAAAAAAAACATAGAAAGA AAATTGATTAATATAAATTTTCATCAACCGATAAATCTAAAATTTGAAAT TAAACTTTTACTAGACAACACAATGCTAACACATCATGTCTTGGTCAAAA TTAAAAAGAAAATTGAAATTAAACTTCTACTAGATAACATAGTGCTAACA CTTTTGTGTCTTGGTAAAAAAAATTCATGTCAAAAAAGTTAATTTTTTTT TTATAGATAAATAGTTAAATTATTGATTGACTATCTTTTTCATTATGTAT TTTGATTTTATTTGTTTTTTACTTTTCACTTTGAGTTAATTGTGGATTGT GTGAAGATACAATTCCTTCTTATAACCATGAGTAAAATTTACCTTATAAC CATGAGTAAAATTTACCTTAACATGAGTGTGAAATTTCTCCATAAGAAAA TGAATGTGAAATAATTGTTCTTTAACTTAAACTAGTAACGAATAATTGTG GATATTTGTTTTCTTTAACTACCTAGGATGACACAAAGTTGACTTTAAAA CATCAATGATGTTCTTTATCAATTTTTTTGATAAAATAATTCATCAAACA TATGATTGTTGATTCTGATTTCTTCTAACCATAATTTGGATATTGTTTTT TCAAGAATAAATGAATATTTGAAATGCTTTGCAAATTAACAAAAGATTTG ATGTTATTGAAATTCATAATACATTGTGATACTATGAAAAACTCTTAGTA ATTAAGAAAAAACAAAAGTGCTATATGCAACAAAAAAAAGGTTTTTATTT TTTAATTAACTGTATCGAATACACATATTAGAAGTAGTGGACTCCACATC ATTCATTGAATCCTATGTTGATCGTTGAAAAACATGCATCATCGTCTCAA ATAACGAAAAAATGTTATCTAATTTTAAGGAGATAAAAACACCTGTCTAT TTTTTTCTATCTTTTTTTTTTTGCTCACGTCATCTTCAACTTGATTTTCT CCACATTTTCATCGCACTTCTATCTCTTCTATAGACTTGAAGGATACATT TCTAACCATCACTAAATTCAAGGAATTCATTTATCTCTATTGACAATAAA TCCAAATCTCATAACTAGGTTGTTGTTCATTTATTCATTTTTCAAAGATA AGAGTTTGCACCTCTTCAAAAGAGCAATCCGTCCATGAGCCAAGCAACCT AAGCCTAGGGCTTTAGGCTTCAAGGAGAAAATGTTGAAATTCAAAATACA TAGTGATAGTATGAAAAACTCGTTGTAGTAAGAGAAAACAAAGATGATCT ATGTCAAAAAATAGTTTTTATTGTTTAATTAATTGCACCGAATAGAGACT TAGAAAGTAGTGGACTCCACATCACTTTTGGGACCCAATATTGACTGTTG AACAAACATGTATCACCGTCTCAAATAACGGAAAAGATTTTTCAATTTTA AGGAAATAAAAACACCTGTCTTGTACCAACCTGTTTTTTTCTATCTCCCA TTTTACTCACATTTCTCCTTCATCTTTATCTTCTCCGTTTTTTAATCACA CTTCTCTTTCCTTTACACACTTAAAAGACACAACTTCTAACTATCACTGA AATTAAGGGATTCATTTCCCTCAATTGACACCAAATCTCATAATTAAGGT ATTCTTCATTTATTCATCTTCCTAACAAAAGAGTTCGCATCTTTTAAAAA AGAACAATATCAGTTTATGGACTAAGCAATCTAATCCTATAGCTTTAGGC CTCAAATTTTAGGGCAAAAAAGCCTAAAAATATAATTTAACTATAAATGT ATAAATGACATATTAGGTGCAGATGTCTTCCAACTTAGTTAGTCAAAACG AGAATATCATATCCTCCTCAATCCATATTTGAACATTGTACTCAGTAAAA TTTGATTTACTTTTATTTTTTATAAATCGTGTGTTCTTTTTAATTTTATT TTAAAAAGAATTATTATAAAATTTATTTGAACCACTAATTATGTTGGGGA ATCTCTCAAAAAGAGTTATGTCTGACAAAATTGTCAAGTTTTCATCTCAA AATATGTATGTCATTATAACATGTTCATAAGAATTAAAAATTCAAATTGA TTTGAATTTTCTAACTTATATTTTATTTTCTAAAACTACCCTTATTTACT CTTTTTAAACCCAAAAGGAATAACTGAAAAAGTAATTGCAAATGGTATGA GAAAATGTGAGGATATATGGTTTCAATGTAAATGGTTTATTTGCTTAAAA TCTATGATTTAAATATGCCATAATTTGTCAATTAACTTACTAATCATATA AATGTGTATCACTATTCCCCTTGATGGTTATGCAGATGCTTTGTTGGTGA AAGCCAAGAGCAGGTAATTTTAGAAGTTGAATCAATATTCTTTTTTATAA GATATTATAAGTTATTAAGTGCTTTCTATTGTAAACATGCATGAGTAATC AAATTGATTGATTTACAACTTAAATTTTAAGGTTTATTGTTCATCCTATA CATTCATATCACTCATCCAATACTAAAAATCAAATTAAGATACACAATCA TATGTTAGTTTTACCTCAATATGTTTTATTCTTAAGTTATGCAAATATAT ACCAATTTTCAAGTCCTATGGTTTATATGTTTTATCTTACAATGTACCAC TTTTTCTCTACAGGAAAGTTATCTTGGACTAGTTCTTTATAATGCAAACT CTGAACTAGGTAATACTTCTATCTTTTTTTTTTTTTTGGTATAAGATATA TGTCATTTATATTGAATGCATGTTATGTTTAAGTACGGTTTTAAAGGTAC AAACCCTAATAAATATGTGTATTTTAGAATTTGAGTTGGACCTAACTCAA CTCTTACAAAATCGATTTGTTAGATGATGATTATCTACCTTTTATAACCA CATTTTCATACATCTCTCACTCAATGCAATACTCTTAACATACCATGACC CCTCACACCCAAGACTAAACATCGGTATCGTGACCTAAGTGGTCTAATAA TAGGTGGCTCAACAAATATCGAATAGTCTCAGACACTATTTTAGAAATTA GTTTGGGCCTTACTCGACCCTTAGAAAGGGAGTTACAAGTTAGTTAAGAT TAAGAGATTTTCTTTCTTCACCATTTTCGGTTTCTAAATTCCATAAATGG AGAGTTTTTAAACCTGTTTTACGCTATCAGAAGATAAAATATGAAATGCA GTAGGGTGTTTCAGAAAAGAGTAGGGCGCGATAAGAAAGCATTTACTATT AATTGTAAGTTGGTTATGATTAGTTAATAATTAAGGCCCAAAAATTAAGG TTAATCTATTGTGATCCAAGCCCAACCATTCAAGGATCCATCAATTAACA TGTGGCTTCTTGCATGAGAAACACTTGGATTGGTGCATGAATAACATTTA GCTTCTTGCATGGAGTACACATGGTTCTTGCATGAAAAACATTTAGCCAG GTGCAATGAATTACACTTGGCTTCCTGCATGGAAGGCACATGATTTCTTG CATGAAAAACACTTACATTTGTGCATGAATAACACATGGCTTATTGCATG AAATATACATGGTTTCTTGCATGAAAAACACTTGGTTTGGTGCATGAATT ACACTTGACTTCTTGCATGGAATGCACATGGTTTCTTGCATGGAAAACAC TTGAATTTGTGCATGGATTACACTTGGCTTCTTTCATGAATAACACTTAG TTTGGTGCATGAATTACACTTGGCTTCTTGCATGGAATATACATGGTTTT TTGCATGAAAAATATTTATATTGGTGCATGAATTACACTTGGCTTCCTGC ATAAAATACACATGGCTTGATGCATGATTAACAATTGGCTTCTTGCATAA AATATAAGTGGCTTCTTGCATGAAATGTGCATGGTATGGTGCATAAATAA AAATTGGCTTCTTGCATGAAACACAAGTGGCTTCTTGCATAAAATGCGCA TGGCGTGGCACATAAATAACAACGGGCTTTTCTTGCATGAAATACAAGTG GCTTCTTGCACGAACTACGCATGGTTTAGTGCATGAATAACATTTGGCTT CCGGCATGAATAACAATTGGATTCTTGATTGAGAAACTTCTTAATTTTCC TTCTATAAATAGAATTCAATAATGTAATTTATGTATAAATTAGAAAATCA AAGTGTATGTTTATGAAACAGAGTGTCTCTGTTTCACCTTGTTGGTTCTT AACTGGTTAGCTTACTAAGATCATCATATAAAATGTACCTTAACTGTTTT TTTTTTTTTTTTATTTTTATAATTTGTCTCATTTTATGAATTTCAACTAA TTTATTTTGTATTCAGTGGAAGCAGGCTATGATATCCAATTTATACACTG GACTAAAGATGTGAATAAATATATGCAAAATTTGTCACATTTATCTTTCA ACGGAAATGATGCAAATCAATCTACCATGGCAGAAGGCCTAGCAGAAGCT CTAGTGGTATGTCAACACACACACACACACACACACACACACACACACAC ACACACACACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATAT ATATATATTTGGATTATTAATTTAACTATATTATATATGTTATTAAGTAA CAATTATAACATTGGTTTTGATTAATCAGATGTATCCAAAGCCATGTGAT ACAATGACAGAAAGAGAATACTATAATTCAGAAAGACATTGTATTCTAGT TGCTCCAGGTGATCCTGCTCCTAAGAGTATGCTAGTGTGTTTGCCAATGA TTCAAAGAGCTCAAGTTATTGGCCAAAGATTAAAGGCTTGTCAGGCCGAT TTTCTCGAGGTCGCCAAAACATGTGTGCCGGTAACATACTAAAATACAAC AAATTTTAATTGTGTATTGCGGCTGCACGATGTAGCGGATGCATAACTGT TAGATCTAAGTGCGGGACCAAATAGTGTCTATTTACACTTAGATTCAACG GCTCTGCAGCCGCTAGAGAAGATTTTTACATGAATTTTTTGATATGGATC TTCTATTGCGGCTGCATGTTTATTGGTTGCAGAGCCGTTGGATCTAGTGC AAGTTTCAATTGTACTCGTTTGCATTTAGATTTAACGGCTCTGCAACCAA AGAAATTTGTTCTATGAAATTGAATGAATTAGACAATTTAGTACTTGAAA TTAACAAAATTCTAAAATGACAACTGAAATTGAAATTTCTTGATTACATA AGGCCTCTGAAATTGAATTGATTTTTAGGGCAAAATTGATCAATTCATAA GGCTAAGCGAATTTTTAAATTTATGAATCATTTCGAAATTTCTTTAATTT CTGAGATTAAATTGTCTAATGTTATAATTTAAGAAAATTAAATGGTGATT TATTTACCTTGATATTATTGATACCGACCATGCTAATTTTTCTACACACA GCTAGCTGTTTCCATGTCAGTGATAACTCCTAATCCAGTTCCAATTTTTG GAGCCATATTTAATATGGTAAGATTTACTCTCTCATATATAACATCATTG AATTGATATCTTAATTTTTGGTCTCTCATAAGGTTTTTGGCACACTTAAA ACTTAAGATTAAGATTTCATTTAGTATAGTCTGTGAGAATTAATGGAACA CACCGCCCCTAAGAGCCTCCGTCCTGGCGACCGGCACTCTACGGCGATTT ACTCGGCCTTCTCTGTCAATCCCTCCAGGCCGACCCAACATGTTAAGAGG CCTAAAGCAAATTTTATAACGAAGCCTTTAGAAATTGAAAGAAATTTTGA GGCCTAAAGCCCTTGCTTGAGTGGCTTGGCCCTAGGGCCGTCCCTGATCC CCTCTGTATGTAGCCCTCTCCAAGCCACCAGCAAATATCTACGACAAAAC TCAGTTTTCCAATGAATGACCAACTGTGTTACAAGTTGATGACATTAGTC TATGTATTTATTTATGTTTTGGTGAGTATGTTGATGATTTTGTTTTCTTT GTCTTGTAGGGAAACAATGTATTAACATTGTCAAATGCTCCAATCTCTAG TTACAGCACTGGCCAATTAACTGTTTTACTGTCAAAAAACTTCAAAGAGG CACACATTGCACTCAAAGGAAAAGGAATAATGGAATATCCTTCAACAACA AGTGTAGCATCAATCAGTGCAGCACCTGATACAACACTTTTCCGAGCTTT CTCTACCAATATTCAAGGTTATTATTTCTCTCCATATATACGTGTGTGCG CGCGCGCGTGTGTTCTGTCACAATTTTTTAAAGCATTTTCTTATTTTCAT TTTATTTGTTTAACATTTTCAGAAGAACAAGTATCCTCCTCTATGGCACT AGGAGACAGAATACGTGAAACTGGCAATACTATAACACCGGTAACGTACC TCTTATATTTATATAATTTTATCTGCTGGAATGATTCGAATCGCTCTATT TTTCGAAATCTATTTTTCTTATGATATTAACATACTATATATTGTTGTTC AGGAGCCTGAAAGCACCTCGCAGCATAATTCTCAGGAGTTGGTTTTATCA AAAGCTACAGATCAGGAGAACGTTGTTCAAATGAATCTATACGAAGATAT CATGTCCGAGCTTGACAGCGAAAGTGATCTTTTTACACCGAATAAAAGAT CGAAAACATTTGCACCAATAGAGGATGACCCTGATCTGCTAGATTTTTTC AAATTTGATCAAAACCCTTTTGAAGGTTTTGACCAATTCCTTGAACAAGA TCAACAAGTATCGAACCAACAACAGATTCCGACGGAAGAAGCTGTATTCA ACCAACAACAGATTCCGACAGAAGAAGCTGTATTCATCCAACAACAGATT CCGACGGAAGAAGCTGGAATAGAGATTGCAAATGAGCTGCAAGAAATTCT GAATGGTGCTTCAAGGAATACATCAACAGCTCAAACTGCCAATGTTGAAT GTACCACAAGTTCATTTCAGGAAGTGAACGTTCAGTCCGAAGAACTACAA GCTCCTACTTCAAATGTCGGAGAAGGGTCTTCGACAGCACTGCTTCATGA AAGCAATTTACAGTCATGGTATAATCCTCACGCCATGACGAGCACATCGA CATTGGATTCTCAGAGTTTCCCAACTAATGTTTTCAACGGGAATGTAACA TTTCCTAATGTAACGGGGAACTCACCGGTGCAGCATCTTCAGCCAGGCTC GTCATTCGATTCTCAGAGTTTCCCAACTAATGTTTTCAATGGGAATTTTA CATTTCCTAATGTAATCGGAAACTCTCAGATGCAGCAACCTCAACAAGGC TCATCACAAAACCAGTTTTCCGTGTTTCCTGGTTTTGCAAGAGGACAAAC AGGCAACTTCTCGGGGCAGCCTGTGGGACAACATTTTCAGGCCAACAACC AGTACCTGAGGAATAATAACACGGCGGCGTCTAATTTTCCTGCAATTGGA GCAAACACTTGGTTTCGTCCGATGCCAAGCTTGTCTCCCTCGTATCTGAG CGCGAGCATGTATTTCCCTACCCTCGAAGAAATACAAGACTACGTTCAGA CGTGGGAGGTAAAATAGATTATGTTTATTATTTAATATTTTAGTATCATA ACTTCATTGTTAGCTTGATTGTGAAGAAATATTTTCTCTGTTGCAGGGAA CACTAGCAGGAAAAATTACGTCAAGTCGCACAACGATCCTGAGAGCAAGG GTATGATAGAATCTTTCTTGACCTAGAACATCTAGTTTGTTTAATATTTT AACATCGTAACAGTTTTTATAGAAATATTTGAAATCAAAATTTGTAGCTT AACATTTTCCTTGTTTCTTTCCTTGTAACAGGCTTTCAGGAAATCAAGTA CGCCACTAACGTAAGTAGATCCTTTTTTATATAACCCTAAATTTTGTAAC AAAACTTTGGTGTTACATTTCTCAAATTAACCCTAATTGTTTTTTATTTA TCTCCTTTTAATTAATAGTTATCAATCATACTAAGTATCCAAAACAAGTA TGAATCAGATTCTTGTTCTGGTTATCGAGGGAAATGGACCTTGATAATCT AGATTCCTCGAACGATCCTTGAATAATGCGCTTAAGTGAAAAATATTATT TTCTGAACTGAGAATTGTTTATTTTTGCTGCATTTTTCAGGCTTACACTT GGCTGGCCTGGTAGGTTAGAGATTAGCAACTATTTCCATCAAAGGACACT CAACCATACCAGGAGGTAATTTTTAATTATTTATGCACAATGATGCATAT TTAAATTAATATTACTCTATTATGTTTTTTTACATATTCTAATAATGTTC AATTGCAGATTTTCACAGCCTATACATTATCTTTTCTTTCATGTGGCTAA GTACAGCAATGTAGATCTATACACGCACTTGAAAACCAGATATGAGGTGA GTCACACACACATATATTCTTGGAGTTCAATTTTTATAAACAATCATATT TACACATTCATCTAATAAGTTGGCTTCTCATAAGTTTAAAAATACATAAA TAATCCTACTAAAGATATGATGTGCTAACAATCTTATACATATATATGTA CATACTGATTTATATGATATAGTCACGTGCATTTTTCTTGCCATTTTTAT TTGAATATGTCTAAATTATTCTGATGTTAAATGTTTTCATGCAGTGTGCA AAAGTAGATCTACAGTTCCAATCAATAATCCTGTCTCCAACAGAAAGAGA ACCAATCTTTGTTGGAACAGTATTCCCTGGG
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Coding sequence (CDS) from alignment at Scc4a34_16:11587..21017-

>MSAD_210042.t1 ID=MSAD_210042.t1|Name=MSAD_210042.t1|organism=Medicago sativa|type=CDS|length=2340bp|location=Sequence derived from alignment at Scc4a34_16:11587..21017- (Medicago sativa)
ATGCATGTATTCAGTCCTGCAGGTCTAAAAGGCTCCAAGTTACATTGTGA
AAATCTAAGAGATCAATTGTTTCAATTACTTAATCACAAATCAATGGAGA
ACAAGAGGTGGTTGAACATAGTAGTTGATGGCAACAAAGCTTTGGAGCAA
TATTGGCATGATATTCTTTCAAACTATCTTGAAAAAATTGTCAGATGCTT
TGTTGGTGAAAGCCAAGAGCAGGAAAGTTATCTTGGACTAGTTCTTTATA
ATGCAAACTCTGAACTAGTGGAAGCAGGCTATGATATCCAATTTATACAC
TGGACTAAAGATGTGAATAAATATATGCAAAATTTGTCACATTTATCTTT
CAACGGAAATGATGCAAATCAATCTACCATGGCAGAAGGCCTAGCAGAAG
CTCTAGTGATGTATCCAAAGCCATGTGATACAATGACAGAAAGAGAATAC
TATAATTCAGAAAGACATTGTATTCTAGTTGCTCCAGGTGATCCTGCTCC
TAAGAGTATGCTAGTGTGTTTGCCAATGATTCAAAGAGCTCAAGTTATTG
GCCAAAGATTAAAGGCTTGTCAGGCCGATTTTCTCGAGGTCGCCAAAACA
TGTGTGCCGCTAGCTGTTTCCATGTCAGTGATAACTCCTAATCCAGTTCC
AATTTTTGGAGCCATATTTAATATGGGAAACAATGTATTAACATTGTCAA
ATGCTCCAATCTCTAGTTACAGCACTGGCCAATTAACTGTTTTACTGTCA
AAAAACTTCAAAGAGGCACACATTGCACTCAAAGGAAAAGGAATAATGGA
ATATCCTTCAACAACAAGTGTAGCATCAATCAGTGCAGCACCTGATACAA
CACTTTTCCGAGCTTTCTCTACCAATATTCAAGAAGAACAAGTATCCTCC
TCTATGGCACTAGGAGACAGAATACGTGAAACTGGCAATACTATAACACC
GGAGCCTGAAAGCACCTCGCAGCATAATTCTCAGGAGTTGGTTTTATCAA
AAGCTACAGATCAGGAGAACGTTGTTCAAATGAATCTATACGAAGATATC
ATGTCCGAGCTTGACAGCGAAAGTGATCTTTTTACACCGAATAAAAGATC
GAAAACATTTGCACCAATAGAGGATGACCCTGATCTGCTAGATTTTTTCA
AATTTGATCAAAACCCTTTTGAAGGTTTTGACCAATTCCTTGAACAAGAT
CAACAAGTATCGAACCAACAACAGATTCCGACGGAAGAAGCTGTATTCAA
CCAACAACAGATTCCGACAGAAGAAGCTGTATTCATCCAACAACAGATTC
CGACGGAAGAAGCTGGAATAGAGATTGCAAATGAGCTGCAAGAAATTCTG
AATGGTGCTTCAAGGAATACATCAACAGCTCAAACTGCCAATGTTGAATG
TACCACAAGTTCATTTCAGGAAGTGAACGTTCAGTCCGAAGAACTACAAG
CTCCTACTTCAAATGTCGGAGAAGGGTCTTCGACAGCACTGCTTCATGAA
AGCAATTTACAGTCATGGTATAATCCTCACGCCATGACGAGCACATCGAC
ATTGGATTCTCAGAGTTTCCCAACTAATGTTTTCAACGGGAATGTAACAT
TTCCTAATGTAACGGGGAACTCACCGGTGCAGCATCTTCAGCCAGGCTCG
TCATTCGATTCTCAGAGTTTCCCAACTAATGTTTTCAATGGGAATTTTAC
ATTTCCTAATGTAATCGGAAACTCTCAGATGCAGCAACCTCAACAAGGCT
CATCACAAAACCAGTTTTCCGTGTTTCCTGGTTTTGCAAGAGGACAAACA
GGCAACTTCTCGGGGCAGCCTGTGGGACAACATTTTCAGGCCAACAACCA
GTACCTGAGGAATAATAACACGGCGGCGTCTAATTTTCCTGCAATTGGAG
CAAACACTTGGTTTCGTCCGATGCCAAGCTTGTCTCCCTCGTATCTGAGC
GCGAGCATGTATTTCCCTACCCTCGAAGAAATACAAGACTACGTTCAGAC
GTGGGAGGGAACACTAGCAGGAAAAATTACGTCAAGTCGCACAACGATCC
TGAGAGCAAGGGCTTTCAGGAAATCAAGTACGCCACTAACGCTTACACTT
GGCTGGCCTGGTAGGTTAGAGATTAGCAACTATTTCCATCAAAGGACACT
CAACCATACCAGGAGATTTTCACAGCCTATACATTATCTTTTCTTTCATG
TGGCTAAGTACAGCAATGTAGATCTATACACGCACTTGAAAACCAGATAT
GAGTGTGCAAAAGTAGATCTACAGTTCCAATCAATAATCCTGTCTCCAAC
AGAAAGAGAACCAATCTTTGTTGGAACAGTATTCCCTGGG
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Properties
Property NameValue
eAED0.14
NoteMediator complex subunit 25 von willebrand factor type A protein MAKER:5.3:0.14:Medtr6g085080
AED0.14
QI0|0|0|0.93|1|1|15|0|780
CADL Non-redundant FlagY
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Medicago sativa2016-01-05
Gene Ontology Update2017-11-12
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Scc4a34_16supercontigScc4a34_16:11587..21017 -
Gene Ontology
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane